Cada acuerdo comercial vigente, establece claramente el sistema de certificación de origen que será utilizado. Actualmente, ProChile es la Autoridad Gubernamental para emitir pruebas de origen a la Unión Europea, EFTA, China y el Reino Unido.
ProChile también delega la tarea de certificar origen en el caso que los acuerdos lo permitan; En la actualidad la Sociedad de Fomento Fabril (SOFOFA) emite certificados de origen para las mercancías industriales y la Unidad Central de Certificación de Origen (UCCO), para bienes del sector agrícola y la pesca.
Las entidades deberán revisar y comprobar que los productos exportados con certificados de origen cumplan los requisitos de origen de los acuerdos comerciales, para cuya misión, utilizan distintos mecanismos de verificación documental y física, con la finalidad de emitir pruebas de origen que acrediten que los bienes exportados son originarios de Chile.
Certificación de Origen Digital a China
A contar del 1° de marzo del 2023, la emisión de Certificados de Origen con destino a China se realiza exclusivamente en forma digital y este sistema actúa en conjunto con el sistema de intercambio de datos vigente.
ProChile desarrolló un nuevo sistema informático que permite recibir electrónicamente los certificados de origen presentados en las entidades pre-certificadoras (SOFOFA y UCCO). ProChile aprobará en línea con sello y firma autógrafa, incluyendo código QR para quienes requieran validar la autenticidad y veracidad del certificado emitido.